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AI識別出290個新蛋白質家族

據瑞士巴塞爾大學官網20日報道,該校和瑞士生物信息學研究所(SIB)的科學家借助機器學習技術,識別出了290個新的蛋白質家族和一個類似花朵形狀的新蛋白質折疊。相關論文發表于最近的《自然》雜志。

在過去幾年里,“阿爾法折疊”徹底改變了蛋白質科學。這種人工智能工具利用科學家在過去50多年收集的蛋白質數據進行訓練,能夠高精度預測蛋白質的3D形狀,去年對2.15億種蛋白質進行了建模,幾乎可以提供任何蛋白質形狀的信息,為科學家更好了解蛋白質進化歷程提供了幫助,但在蛋白質研究領域,仍有很多秘密等待揭示。

研究團隊此次構建了一個由5300萬個蛋白質組成的互動網絡——蛋白質宇宙圖譜,以更好地大規模預測未知蛋白質家族及其功能。在此基礎上,研究團隊識別出290個新的蛋白質家族和一個類似花朵形狀的新蛋白質折疊。

研究人員指出,使用基于深度學習的工具在“蛋白質宇宙圖譜”中尋找未知蛋白質,為生命科學的創新鋪平了道路。“蛋白質宇宙圖譜”有助研究更多蛋白質,而了解蛋白質的結構和功能是開發新藥或通過基因編輯工具改變蛋白質功能的第一步。

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