9月21日0—24時，31個省（自治區、直轄市）和新疆生產建設兵團報告新增確診病例41例。其中境外輸入病例25例（云南14例，上海6例，福建2例，廣東2例，四川1例），含2例由無癥狀感染者轉為確診病例（福建1例，四川1例）；本土病例16例（福建13例，其中廈門市11例、莆田市2例；黑龍江3例，均在哈爾濱市）。無新增死亡病例。新增疑似病例2例，均為境外輸入病例（均在上海）。
當日新增治愈出院病例37例，解除醫學觀察的密切接觸者797人，重癥病例較前一日增加2例。
境外輸入現有確診病例532例（其中重癥病例5例），現有疑似病例4例。累計確診病例8868例，累計治愈出院病例8336例，無死亡病例。
截至9月21日24時，據31個省（自治區、直轄市）和新疆生產建設兵團報告，現有確診病例984例（其中重癥病例14例），累計治愈出院病例90231例，累計死亡病例4636例，累計報告確診病例95851例，現有疑似病例4例。累計追蹤到密切接觸者1182333人，尚在醫學觀察的密切接觸者16770人。
31個省（自治區、直轄市）和新疆生產建設兵團報告新增無癥狀感染者9例（均為境外輸入）；當日轉為確診病例2例（均為境外輸入）；當日解除醫學觀察14例（均為境外輸入）；尚在醫學觀察的無癥狀感染者342例（境外輸入333例）。
累計收到港澳臺地區通報確診病例28381例。其中，香港特別行政區12166例（出院11878例，死亡213例），澳門特別行政區63例（出院63例），臺灣地區16152例（出院13742例，死亡840例）。
